تدور أحداث القصة بعد أن تم القضاء على 90٪ من البشرية بسبب الغزو. يعيش الناجون في ملجأ حيث تُراقب حياتهم، وتُمسح ذكريات الغزو. تم اختيار ثلاثة مراهقين من الملجأ لتجربة ثلاث آلات تتحد لتشكل روبوت “موساشي”، المصنوع من مادة تسمى سبيكة “ميغاترونيوم”. يركز الانمي على كل من العمل مع الروبوت، والحياة المدرسية.